Commentaires de l'actualité archives (les pictogrammes indiquent le sujet du commentaire: scientifique , philosophique ou politique )
12/2009	Une démarche à soutenir : http://www.lire-ecrire.org/accueil.html qui prolonge l'Appel pour la refondation de l'école avec notamment les réflexions très intéressantes de Laurent Lafforgue dont je me suis déjà fait l'écho sur ce site. Il faut sans aucun doute ajouter Michel Segal à la liste des enseignants qui ont quelque chose d'intéressant à dire. Une histoire (30 min) racontée par Michel Segal qui mérite d'être écoutée sur Scoladon ou avec ce lien direct (41,4 Mo)
11/2009	Première partie des pages sur les génomes...
09-10/2009	Enfin un article de vulgarisation pédagogiquement valable dans La Recherche ! Il faut saluer l'article de Marie-Laure Théodule " Maladie d'Alzheimer : trois nouveaux gènes identifiés " dans le n° 435 du mois de novembre 2009. Les propos tranchent radicalement des habituelles fadaises sur la liaison génotype-phénotype. Il y a un vrai effort d'expression scientifiquement exacte tout en restant accessible à un large public. Chapeau ! L'histoire rapportée montre clairement les méthodes, les objectifs, les financements et les espoirs portés par cette longue traque génétique tant in silico que lors d'analyses génétiques de populations tests. Même l'encadré sur la prudence nécessaire à l'interprétation des tests est clair et exact. Voilà un texte à utiliser en classe... pour les terminales. La Recherche m'a autorisé à placer une copie sur ce site (les images en moins). Pour tirage voici une copie en version texte. Après 2 ans d'attente depuis la publication de Génétiquement indéterminé aux éditions Quæ (voir ci-dessous), La Recherche publie enfin un dossier sur l'indéterminisme: Le hasard au cœur de la vie, octobre 2009, 434. Mais l'autonomie et la variabilité sont les grands absents de ce dossier qui ne parle que de la vision de Kupiec; le livre cité ci-dessus n'est même pas référencé !!! Et puis, il n'y a aucune ouverture sur une autre approche de la causalité que celle de Kant qui sépare le déterminisme, seul scientifique pour lui, et la liberté (voir biologie théorique et 4 causes en SVT). L'"indéterminisme" des systèmes génétiques présentés reste un déterminisme moléculariste statistique; il y a une certaine incapacité à penser le vivant au travers des fonctions et autres grandeurs mathématiques. Une occasion manquée.
08/2009	En observateur de plus en plus averti, Denis Duboule fait une intervention remarquable lors de la séance de l'Académie des sciences du 30 juin 2009 consacrée à Darwin... à écouter sur Canal Académie (son intervention correspond à la dernière demi-heure de l'enregistrement). Il parle avec beaucoup de justesse de " théorie de la variation contrainte ", de la séparation inéluctable entre l'évolution et la génétique, et enfin du rôle central du temps. Cependant sa conférence du 21 février 2006 à l'Académie des Sciences (disponible sur l'IN2P3) " La génétique moléculaire de l'évolution ; une science du XXIe siècle ? " où il présentait déjà les mêmes thèses, me paraît plus complète, et moins conformiste puisqu'il y égratignait gentiment les néodarwiniens dogmatiques. J'ai intégré certaines de ses idées "postdarwiniennes" à ma page sur l'évolution.
02/2009	Une page qui tranche avec toutes les autres: La création selon la Foi catholique. Je ne parle pas de Dieu dans mes cours ni dans aucune page de ce site. Mais je suis catholique. Au nom d'un athéisme méthodologique on parle beaucoup contre Dieu: enseignants, élèves, parents, Éducation Nationale. Il ne faut pas confondre laïcité (la dimension transcendante de l'homme n'empêche en rien la légitime autonomie de la société civile) et le laïcisme (qui refuse à l'homme sa dimension transcendante). Au-delà de "la vie est le mystère qui est le vrai sujet de la biologie", si j'avais à parler de Dieu, sur les sujets traités ici , voici donc ce que je dirais... À titre expérimental je lance un FORUM ouvert pour ces questions de relations entre science et foi
12/2008	Cette aventure touche à sa fin. Tout est parti de "la vie est un travail" et tout doit y revenir. C'est la question centrale. Soit la biologie se constitue en science de la vie, au carrefour des sciences expérimentales et des sciences de l'homme, soit elle est vaine. Lamarck, en constituant le mot biologie, pour désigner une science du vivant vitaliste et mécaniste, avait clairement ce projet. Il n'a pas été suivi, du moins comme penseur du vivant, même si c'est bien en direction d'un matérialisme mécaniciste que les scientifiques sont allés, par un renversement paradoxal de l'explication physico-chimique, vitaliste, en mécanisme. Les idées de Bergson représentent pour moi l'espoir d'une biologie qui réconcilie l'homme avec son animalité et son histoire. Et le travail de René Thom porte en germe la possible réconciliation scientifique entre matérialisme et idéalisme.
12/2008	Pour tous, un livre d'André Pichot, au carrefour de l'épistémologie et de l'histoire des sciences: Histoire de la notion de vie, Gallimard, 1993 (16 euros); quelques extraits sur deux pages: le darwinisme moderne, afin de dépister les incohérences que l'on colporte dans l'enseignement, et la notion de vie aujourd'hui, où l'auteur présente une conception personnelle originale qui réconcilie matérialisme et évolutionnisme (sans nier l'originalité de la vie).
07/2008	J'ai inséré dans le cours sur la nutrition de terminale des extraits des travaux de Nissim Amzallag (L'homme végétal. Pour une autonomie du vivant, 2003, Albin Michel) qui tournent autour de l'autonomie du vivant : * le CO2 n'est pas un facteur limitant de la croissance de la plante (ce qui invalide le discours de certains concernant les conséquences de l'évolution de la teneur de l'atmosphère en CO2 au cours des dernières décennies); * des plantules voisines ne luttent pas pour la lumière (idée de compétition) mais au contraire adaptent leur croissance à celle de leurs voisines; * la baisse de croissance d'une plante dont le système racinaire est partiellement asséché cesse si l'on supprime le réseau racinaire inutile; ce qui indique que la plante cherche un équilibre pour sa croissance entre le niveau des ressources et ses propres caractéristiques physiologiques; * la symbiose, notamment mycorhizienne, semble davantage tenir de la concorde (utilisation harmonieuse conjointe des ressources) entre espèces que de supposés bénéfices ou d'une dépendance...
1/02/07 1/03/2007 ...	Génétiquement indéterminé - le vivant auto-organisé est paru aux éditions Quæ (Cemagref, Cirad, Ifremer, Inra) et est disponible http://www.quae.com/livre/?GCOI=27380100948540; à lire d'urgence : Avec les mots de Sylvie Pouteau « L'hypothèse du déterminisme génétique [i.e. du programme génétique, c'est moi qui ajoute] ne permet plus de faire avancer les connaissances en biologie. C'est sur ce constat de départ qu'un cycle de conférences a été organisé à l'Institut Jean-Pierre Bourgin de l'INRA à Versailles, autour du thème de la complexité et des nouvelles approches en biologie. Cet ouvrage reprend le contenu de quatre d'entre elles». plan du livre Le chapitre de G.N. Amzallag sur la variation (Ch 1 : Du sens de la variabilité) me paraît être un incontournable pour un enseignant. Les exemples sont tirés principalement des travaux de l'auteur sur les brassinostéroïdes, les gibberellines et la tolérance-adaptation au NaCl (...) chez quelques plantes. C'est une vraie réflexion d'expérimentateur qui ouvre bien des perspectives sur l'analyse des données expérimentales; c'est un appel à créer de nouveaux outils d'analyse dans une perspective ouverte sortant du génétiquement déterminé. Les indicateurs utilisés en écophysiologie évolutive sont interrogés : plasticité, canalisation , coefficient de variation, connectance.... À intégrer de toute urgence dans les cours universitaires, pour le lycée je ne pourrais encore une fois que me contenter de citer les conclusions sans pouvoir m'appuyer sur l'étude d'exemples dont le niveau d'analyse est trop élevé pour le secondaire . On pourrait regretter la prudence de l'auteur car les articles cités sont en anglais et le lecteur doit y avoir accès voir saisir la profondeur du propos mais comme il le dit lui-même ...« on ne s'étonnera pas que les résultats et les conclusions présentées ici soient encore très lacunaires. Ils ne forment que l'ébauche d'une approche d'un horizon encore largement inexploré, pour des raisons non seulement conceptuelles, mais encore pratiques.» Page récente présentant sa démarche J'ai été suffisamment intrigué et passionné par l'article de Vincent Fleury (Ch4, Morphogenèse des structures arborisées et conditions physiques d'une croissance biologique auto-organisée, 111-140) pour passer outre des petites difficultés de style et de quelques maladresses vis-à-vis de la description des systèmes biologiques, et acheter deux de ses ouvrages (Des pieds et des mains ; Genèse des formes de la nature, Flammarion, col. Champs, 2003 et De l'œuf à l'éternité - Le sens de l'évolution, Flammarion, 2006 à destination du grand public (et donc de mes élèves)). On y retrouve les mêmes défauts mais on y trouve aussi d'excellentes choses. Voilà un physicien passionné par le vivant qui aborde les questions par un côté encore bien inexploré : la morphogenèse. Il rejoint donc la famille des Grassé, Thom et autres scientifiques résolument tournés vers un nouveau paradigme. V. Fleury n'a pas toujours la prudence d'expression de N. Amzallag et le choix de la médiatisation (peut-être trop rapide) de ses idées fera fuir certains biologistes, c'est dommage. Car, sans êtres abouties, ses idées et ses ouvrages sont des ouvertures qu'il ne faut pas négliger. Je m'inscris résolument à ses côtés. Pour en revenir au chapitre 4 de Génétiquement indéterminé, le texte est très accessible à des lycéens. J'utiliserais ses propos dans mes cours. Mais je persiste à penser que la vision mathématique de René Thom sur la morphogénèse est autrement plus profonde (voir la page sur les modèles thomiens) que la simple prise en compte des lois physiques en biologie qui constitue cependant une démarche à encourager.
	Une nouvelle source d'idées et quelle source ! À conseiller à tous : L'homme végétal : pour une autonomie du vivant, Gérard Nissim AMZALLAG, Albin Michel, 2003 (préface de Bernard Werber); c'est un plaidoyer contre l'organisme vivant-machine. Un vrai travail de biologiste qui revendique un objet et des méthodes propres. C'est fort bien documenté (avec les références des articles scientifiques) et rédigé dans un langage très accessible, parfait pour des lycéens. L'appui théorique qu'il prend sur les structures dissipatives de Prigogine, est pour moi discutable car c'est une théorie qui confère au hasard une existence qu'il n'a pas à mon sens, mais n'enlève rien à la qualité de sa réflexion. Beaucoup mieux encore, il propose une véritable théorie de l'évolution à l'aide de sa notion de dissociation autonome. Les périodes de stabilité de l'organisme alternant avec des périodes de dissociation, initiées par l'organisme lui-même (sécrétion d'AMPc chez les bactéries, d'un stéroïde chez les pluricellulaires ?), qui lui permettent, après un retour transitoire des parties (cellules, organes) à plus d'autonomie, de retrouver un état NOUVEAU de stabilité qui émerge des nouvelles interactions existant entre ses parties et le milieu auquel l'organisme devient alors extrêmement sensible. C'est donc pendant ces crises (métamorphoses) qu'il y a adaptabilité et développement et.... évolution (c'est moi qui prolonge l'idée sous-entendue). L'état adulte d'un pluricellulaire serait la perte de la capacité à entrer en dissociation autonome selon les modalités régnant lors des crises du développement. Il expose enfin une théorie du développement psychique de l'homme et de la conscience en distinguant différents niveaux de dissociations plus ou moins autonomes. Le titre fait référence à l'analogie de développement (rapporté à des dissociations autonomes) que l'on peut établir entre le cerveau (perpétuellement en crise de développement) et un végétal (possédant une embryogénie indéfinie). La résonance féconde entre la dissociation autonome de Nissim Amzallag et la progression autonome de Rosine Chandebois n'échappera à personne (voir une page annexe déjà ancienne sur la théorie de cette dernière). La raison malmenée. De l'origine des idées reçues en biologie moderne, Gérard Nissim AMZALLAG, CNRS Éditions, 2002 Une histoire des idées en biologie qui n'hésite pas à traquer le mensonge (qui finalement est omniprésent chez les scientifiques, soit comme un ami soit comme un ennemi). Salutaire. A mettre entre les mains de tous les élèves qui veulent s'orienter vers la recherche. Cet ouvrage fait le pendant de l'ouvrage précédent. Il me paraît judicieux de le lire après avoir lu L'homme végétal pour que la nudité des critiques soit voilée par la profonde sincérité qui émane des idées fécondes du premier ouvrage. Un enseignant de SVT honnête ne peut pas enseigner le programme actuel de lycée sans y ajouter bien des remises en cause. C'est une question de vérité. Ce livre peut beaucoup l'aider dans sa démarche. (Plan, préface et introduction sont disponibles à l'adresse: http://netmc.9online.fr/AdV/Amzallag_Raison.html )
Les diapositives de la conférence donnée au Palais des Congrès de Poitiers le samedi 8 octobre 2005 (Conférence grand public - 20h30) pour le 4ème Congrès Mondial "de" Biologie Cellulaire et Moléculaire (voir la plaquette de présentation sur le site de la région Poitou-Charentes. Congrès international organisé avec le soutien de la revue CMB, Cellular and Molecular Biology: http://www.cmbworldcongress2005.com) sont disponibles en ligne (avec quelques explications complémentaires) Je renvoie aussi à deux pages présentant les fondements de ce qui a été rapidement abordé lors de cette conférence: la cellule, une théorie des modèles.
Buts Ce site s'adresse d'abord à mes élèves (actuels et anciens) et ensuite à mes collègues (comme base de discussion). Ce site est bien sûr une expérience : j'ai hésité longtemps avant d'oser taper ces pages et il faudra certainement encore plus de temps pour qu'elles reflètent réellement ma pensée. Pour dire en quelques mots les motifs qui me poussent: * un souhait "réenchanter la science"... mais avec ma propre personnalité (je suis piètre animateur au sens moderne.... et pourtant quelle merveille d'animer, de donner de l'âme...les animateurs me paraissent souvent des agitateurs de vent...pour le style "C'est pas sorcier" voir les traces de mon passage à l'iufm), que les élèves s'émerveillent devant une enzyme active, devant deux cellules qui se séparent, devant un imago qui sort de son exuvie... et cherchent de toute leur INTELLIGENCE à comprendre sans se contenter des fables que leur distillent parfois leurs manuels scolaires ou les médias. * la certitude qu'il est urgent d'introduire dans l'enseignement de SVT (et aussi de Physique-Chimie) une partie officiellement dévolue à l'histoire des sciences et à l'acquisition de la démarche expérimentale (ce qui peut se faire aussi dans le cadre d'une initiation à la philosophie... pourquoi pas avant la terminale); En fait je crois qu'il faudrait mieux parler d'une histoire de la raison humaine et de certains concepts des SVT. Je suis souvent amené lors de l'élaboration de mes cours à parler de changement de paradigme. Mais je précise que ma pensée n'est pas du tout issue d'une philosophie New Age mais bien d'une recherche de la vérité pour laquelle je crois que la raison humaine est faite (je considère l'encyclique de Jean-Paul II "foi et raison" comme une référence incontournable (http://www.vatican.va/edocs/FRA0075/_INDEX.HTM), au sujet du New Age on peut voir http://www.vatican.va/roman_curia/pontifical_councils/interelg/documents/rc_pc_interelg_doc_20030203_new-age_fr.html). * la nécessité de modifier fondamentalement les programmes pour en revenir au réel, à l'observation du vivant et de ne présenter une technique aux élèves que lorsqu'ils peuvent en maîtriser l'analyse, bref, faire peu de choses mais plus à fond. La version commentée des programmes est devenue obsolète au 24/08/2001 et étant donné que le cours est maintenant assez étoffé, elle ne sera pas reprise sous cette forme dans la prochaine mouture du site. * la conviction (acquise récemment - 2004) que l'avenir des Sciences de la Vie et de la Terre passe par la mathématisation («les mathématiques sont le langage universel», René Thom), non pas à cause de leur objet (qui peut être abordé de bien d'autres manières) mais à cause de la scientificité qui nécessite une intersubjectivité (un consensus en fait) que la philosophie ne peut donner seule. Le développement de la Biologie Théorique est le grand défi du XXIème siècle pour les sciences de la vie.
Avertissements Ce site est une page personnelle. Les textes personnels présentés peuvent être utilisés dans le respect de la propriété intellectuelle. Les textes recopiés d'autres auteurs ne le sont qu'à but strictement pédagogique et les sources sont toujours citées. Les illustrations sont originales, sauf mentions spéciales et dans ce cas volontairement présentées avec une résolution les rendant inutilisables pour un autre but que celui d'illustrer le cours. Les options pédagogiques et intellectuelles ne regardent que l'auteur et n'ont en aucun cas une reconnaissance officielle des autorités pédagogiques ou administratives de l'éducation nationale. L'auteur s'engage à répondre à tous les courriers décents et pertinents. Cependant, suite aux demandes d'élèves qui me sollicitent pour les aider à rechercher des documents, notamment pour les TPE, ou même à résoudre leurs exercices scolaires (!!!) je précise que ce n'est pas le rôle de ce site. Voyez l'énoncé des buts ci-dessus. Je peux par contre répondre à une demande d'éclaircissement (sur une question détaillée dans ces pages) correctement formulée et faisant preuve d'un niveau de connaissance honorable...
	mon mél est : pierre point stouff arobase libertysurf point fr.
Site démarré le 2 septembre 1998...

Recherche sur ce site dans Google
Tapez dans la zone de recherche de Google (ou de votre navigateur ?) les mots recherchés suivis de site:http://pst.chez-alice.fr
(si je place ici une fenêtre de recherche (avec un script), votre navigateur et votre encodage seront inconnus du moteur de recherche et les résultats seront mal formatés). Notez bien que le moteur ne trouve que les pages qu'il a indexées.