d'après Biologie moléculaire de la cellule, Alberts et al., 1994, Tableau 3-1 | % de la masse cellulaire | |||
composants chimiques | cellule procaryote | cellule eucaryote | ||
H2O | 70 | |||
ions minéraux (Na+, K+, Mg2+, Ca2+, Cl-, Fe3+...) | 1 | |||
petits métabolites organiques : acides, alcools... | 2 | |||
macromolécules (polymères) |
protéines (protides) | 15 | 18 | |
molécules organiques | acides ribonucléiques (ARN) | 6 | 1,1 | |
acides désoxyribonucléiques (ADN) | 1 | 0,25 | |
|
glucides complexes (osides) | 2 | |||
lipides | les
lipides ne sont pas des polymères, mais peuvent former
de très grosses molécules grâce à
des liaisons faibles |
2 | 5 |
Pour des données sur l'eau cellulaire voir la page "au-delà de la cellule". Pour les minéraux il est nécessaire de savoir qu'ils sont avant tout hydratés (ils sont entourés d'une sphère d'hydratation; par exemple K+,4H2O) et ensuite souvent liés à certaines molécules : le Fe en est un exemple évident au sein de l'hème de l'hémoglobine (voir ci-dessous).
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Applet du haut QUELQUES
OSES sous forme linéaire
Commandes JSmol: Modèles de la molécule : compact, squelette, boules et bâtons 3 carbones : les trioses (C3H6O3) ne sont que 2 : - la dihydroxyacétone pour la forme cétose avec le groupe cétone (=C=O) - le glycéraldéhyde pour la forme aldose avec le groupe aldéhyde (-HC=O) 4 carbones : (C4H8O4) par exemple l'érythrose. 5 carbones : le ribose (C5H10O5) et le désoxyribose (C5H10O4) qui interviennent notamment dans les acides nucléiques sous une forme cyclique (voir applet du bas et ci-dessous); et le ribulose (C5H10O5) qui intervient dans la photosynthèse. 6 carbones : (C6H12O6) le glucose, mais on peut aussi citer le galactose et le fructose. |
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Applet du bas QUELQUES
OSES sous FORME
CYCLIQUE
Commandes JSmol:
Modèles de la molécule : compact,
squelette,
boules
et bâtons Une des formes cycliques du glucose ( αD-glucopyranose - passage d'un glucose linéaire à un glucose cyclique: image externe) avec un cycle à 6 côtés (heaxgonal) et 5 carbones. Les deux sucres composant de l'ADN ont une forme cycliques (avec un cycle pentagonal - à 5 côtés, et 4 carbones) : le ribose cyclique est sous une forme apellée ribofuranose et le désoxyribose est sous la forme de désoxyribofuranose (il existe différentes formes selon la position des OH /plan du cycle). |
Test : pourquoi le gycérol, un trialcool n'est-il pas un sucre ? |
Quelques
commandes pour JSmol: Modèles de la molécule compact squelette boules et bâtons cartoons Couleurs des atomes : cpk - a.a. colorés modèle cartoon : a.a. colorés, chaînes colorées (couleurs de références page JSmol) |
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RéactifA | ProduitC + chaleur | |
RéactifB | ProduitD |
glucose | glucose-6P + chaleur | |
ATP + 2 H2O | ADP + H3O+ |
L'étude
de
la chimie du vivant est la biochimie
(la
biologie
va donc s'appuyer sur des connaissances de chimie:
classification périodique,
atomes,
molécules,
liaisons...).
3 - les lipides (2% de la masse des cellules procaryotes et 5% de celle des cellules eucaryotes) sont soit des acides gras (groupement -COOH et longue chaîne de -CH2- ou -CH=CH- et dans ce cas la molécule forme un coude à ce niveau) soit des graisses qui sont issus de l'association d'un alcool avec un ou plusieurs AG. Les triglycérides (association de 3 AG avec le glycérol) sont les graisses habituelles des animaux). Ils sont insolubles dans l'eau et possèdent un pôle hydrophobe (qui repousse l'eau). Les phospholipides (alcool + acide gras + groupement phosphate) composent notamment toutes les membranes de la cellule, dont la membrane plasmique qui borde la cellule. |