L'acétylcholine (abrégée en ACh) est peut être le plus connu de tous les neurotransmetteurs car c'est le premier à avoir été identifié. Elle est composée de la choline (alcool aminé que l'on retrouve notamment dans la phosphatidylcholine, phospholipide membranaire) qui se lie à l'acide acétique. Elle est synthétisée dans le cytoplasme à partir de l'acétylcoenzymeA (acétyl-CoA), un élément essentiel du métabolisme qui intervient dans la respiration cellulaire au niveau des mitochondries. Les neurones à acétylcholine sont dits cholinergiques. Chaque vésicule synaptique stocke environ 10.000 molécules d'ACh. C'est par voie de dégradation enzymatique (par l' acétylcholine estérase, AChE, 1ACJ, voir pdb-101 que le neurotransmetteur est détruit dans le fente synaptique (chaque molécule d'AChE dégrade environ 5.000 molécules d'ACh par seconde), et non par recapture.
On trouve ensuite des acides aminés qui ont une fonction locale de neurotransmetteur : l'aspartate (Asp) , la glycine (Gly) , le glutamate (Glu), ou encore des dérivés d'acides aminés comme l'acide gamma aminobutyrique (GABA).
Des bases de type purine associées en nucléotide comme l'adénosine triphosphate (ATP) peuvent aussi jouer le rôle de neuromédiateur.
Le monoxyde d'azote (NO) est un cas particulier de neurotransmetteur gazeux qui n'est pas stocké dans des vésicules synaptiques, mais est produit lors de l'arrivée du signal électrique présynaptique, est libéré, et agit sur les cellules avoisinantes, même éloignées de quelques dizaines de micromètres.
Les monoamines (ou amines biogènes) forment un groupe important de neuromédiateurs dérivés de la tyrosine qui est transformée en DOPA (dihydroxyphénylalanine) :
- le groupe des catécholamines : dopamine , noradrénaline (NAdr) et adrénaline (Adr) qui sont les neurotransmetteurs du système nerveux végétatif (autonome), surtout sympathique;
- la sérotonine (5HT : 5-hydroxytryptamine) du groupe des indolamines, très présente dans le système nerveux central;
- l'histamine du groupe des imidazolamines, qui est aussi une substance qui intervient dans le système immunitaire comme cytokine.
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