substances organiques: glucides, lipides, protides et acides nucléiques

glucides

ils sont composés de C, H et O (ils sont dits "ternaires")
leurs groupes caractéristiques peuvent être de type alcool (R-OH), aldéhyde (R-CH=O) et cétone (R-CR'=O)

glucides simples (oses ou monosaccharides): parmi les glucides (3,4, 5, 6 ou 7 carbones), deux groupes sont à connaître; ils sont habituellement sous forme cyclique :
C5 (5 atomes de C) = pentoses, par exemple le ribose: C₅H₁₀O₅
C6 (6 atomes de C) = hexoses, par exemple le glucose : C₆H₁₂O₆

4 hexoses ont la même formule condensée: C₆H₁₂O₆ ; glucose, galactose, fructose et lévulose;
ces molécules sont des stéréoisomères qui différent par la position de leurs groupes ou atomes reliés à leurs carbones asymétriques (ces carbones possèdent 4 groupes différents).

glucides complexes (osides)
* certains ne contiennent que des oses:
- par exemple deux oses (diosides ou disaccharides): le lactose (glucose + galactose) du lait, le maltose (glucose+glucose) de l'orge germé, ou le saccharose (glucose + lévulose) de la canne à sucre (la betterave sucrière contient du raffinose qui est formé de 3 sucres simples: un galactose et un saccharose, ce qui donne un galactose, un glucose et un lévulose).
- d'autres osides contiennent un très grand nombre d'oses (polyosides ou polysaccharides): trois sont incontournables même si les oses qui les composent sont plus compliqués que ceux donnés plus haut): la cellulose (MM ~500.000); le glycogène (MM ~qq millions); l'amidon (MM ~500.000) (http://crpp0001.uqtr.uquebec.ca/COR/sr/Starch.PDB)
* certains contiennent d'autres groupes nos osidiques comme la chitine (formant la cuticule des Arthropodes: Insectes, Crustacés...)

lipides

ils sont composés de C, H et O (ils sont dits "ternaires")

ce sont des esters d'alcool et d'acides gras (A.G.)

* les A.G. étaient appelés des "polyhydrates de C": leur formule est: CH₃ - (CH₂)_n - (CH)_m - COOH
le nombre n de groupes CH₂ détermine le nombre (n/2) de liaisons simples (saturées) et le nombre m de groupes CH détermine le nombre (M/2) de doubles-liaisons (insaturées). Par exemple l'acide palmitique (que l'on trouve dans l'huile de palme) à pour formule C₁₅H₃₁-COOH soit n=14 et m=0; l'acide oléique (que l'on trouve dans l'huile d'olive) C₁₇H₃₃-COOH avec n=14 et m=2 (sept liaisons simples et une double-liaison occasionnant un coude dans la molécule).

* selon l'alcool on distingue par exemple:

• les glycérides dont l'alcool est le glycérol (c'est un trialcool car il possède 3 groupes alcool) CH₂OH-CHOH-CH₂OH
  selon le nombre d'acides estérifiés au niveau de chaque groupe alcool on a des monoglycérides (un seul AG), des diglycérides (2 AG) et des triglycérides (3 AG).
• les stéroïdes dont l'alcool est le cholestérol (présente 4 noyaux fusionnés et un seul groupe caractéristique alcool, il ne peut donc fixer qu'un seul AG). Les stéroïdes comprennent notamment des hormones sexuelles de nombreux organismes (progestérone par ex.).

Certains lipides possèdent d'autres groupes (ni alcool ni AG) comme les phospholipides, constituants principaux des membranes cellulaires (avec le cholestérol).

protides

ils sont composés de C, H, O, N, et S (ils sont dits cependant "quaternaires" car CHON sont majoritaires)

Ce sont des polymères d'acides aminés (R-CHCOOHNH₂) (liste dans la page sur le code génétique) reliés par des liaisons peptidiques (voir cours synthèse des protéines). Des liaisons S-S (ponts disulfures) peuvent s'établir entre deux groupes caractéristiques -SH appartenant à deux cystéines (Cys). Des liaisons hydrogène et faibles (Van der Waals et hydrophobes) s'établissent aussi entre les aa. Plusieurs chaînes peuvent être associées.

acides nucléiques

ils sont composés de C, H, O, N, P et S

Ce sont des polymères de nucléotides, eux-mêmes composés d'une base azotée, d'un pentose et d'un groupement phosphate. On distingue les ADN, molécules à 2 brins et formés de désoxyribonucléotides (le sucre est le désoxyribose et les bases sont A, T, C ou G) et les ARN à un seul brin formé de ribonucléotides (le sucre est le ribose, les bases sont A,U ,C ou G). Voir cours de seconde.

substances minérales

nutriments
* les nutriments sont les substances organiques nutritives que l'on trouve DANS l'organisme (dans le milieu intérieur ou liquides intérieurs - sang et lymphe (voir cours général circulation ou alimentation) ); cette définition (stricte) exclue les gaz (O2) et les autres substances minérales.
* le métabolisme recouvre l'ensemble des réactions chimiques de l'organisme et recouvre le catabolisme (réactions de dégradation) et l'anabolisme (réactions de synthèse)

aliments dégradés par des enzymes dans la lumière de l'appareil digestif		métabolites barrière intestinale (entérocytes) absorption, formation des nutriments		nutriments (quelques) circulants dans le milieu intérieur: sang et lymphe
glucides complexes et simples	>>>	glucides simples	>>>	glucose
lipides	>>>	alcools et AG	>>>	alcools, AG (dans la lymphe puis dans le sang sous forme de particules contenant des AG, du cholestérol (alcool) et des protéines)
protides	>>>	aa	>>>	aa
acides nucléiques	>>>	catabolisme