. Les acides nucléiques - HTML5
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Page en travaux - essai d'HTML5 -JSmol - édité avec Blue Griffon- des bugs sont connus et en cours de débogage :
Firefox recommandé (Safari ne fait pas bon ménage avec Java)

L'ADN - acide désoxyribonucléique
Jmol évolue en JSmol pour intégrer l'HTML5
L'applet JME - éditeur 2D de molécules - de  Peter Ertl (from Novartis) est aussi disponible , avec son code source, gratuitement

2D - NE FONCTIONNE PAS BIEN

Commandes (autres : clic droit) :
2D   3D

Compact   squelette  boules et bâtons

couleurs :
cpk
uni  

nom/n° atomes  : vus - cachés

Cliquez pour visualiser les composants :
-
les 4 bases azotées : les 4 nucléotides :
adenine
guanine
cytosine
thymine
nucléotide à adénine
nucléotide à guanine
nucléotide à cytosine
nucléotide à thymine
  - le sucre : désoxyribose
 - le groupe phosphate
- les deux types de nucléotides appariés par leurs bases complémentaires :
A-T
C-G
 couleurs des atomes dans le modèle CPK
Commandes
Compact,
 squelette,
 boules et bâtons,
 cpk,
 uni


cartoons

Cliquez pour visualiser les composants :

Un peu plus d'un tour d'hélice : les 4 nucléotides :

molécule d'ADN de 12 paires de bases avec 80 molécules d'eau

molécule d'ADN sans les 80 molécules d'eau
nucléotide à adénine
nucléotide à guanine
nucléotide à cytosine
nucléotide à thymine
 
- les deux types de nucléotides appariés par leurs bases complémentaires : (A-T) : (C-G)

Les ARN - acides ribonucléiques



Commandes
(autres : clic droit)
2D,
3D,
 Compact,
 squelette,
 boules et bâtons,
 cpk,
 uni


nom/n° atomes
vus - cachés

Cliquez pour visualiser les composants d'un ribonucléotide :
- les 4 bases azotées :
adenine
guanine
cytosine
uracile

  - le sucre : le ribose
 - le groupe phosphate

Un ribonuléotide à rôle métabolique (transfert d'énergie dans les réactions chimiques) :
adénosime triphosphate (ATP)
adénosime diphosphate (ADP)
adénosime monophosphate (AMP)
couleurs des atomes dans le modèle CPK
Commandes
Compact,
 squelette,
 boules et bâtons,
 cpk,
 uni


ARNr cartoon vert

protéines a.a.

Cliquez pour visualiser deux exemples d'ARN:

molécule d'ARNt (de transfert) avec ses 104 molécules d'eau

fichier très lourd - patience
 ribosome bactérien (ARNr et protéines)>
(avec une grosse sous-unité (50S) de 2 ARNr (5S+23S) et 32 protéines,
et une petite sous-unité (30S) avec 1 ARNr (16S) et 21 protéines ;
le swedberg (S) est une unité de centifugation ;
ce ribosome est celui du procaryote Thermus thermophilus (base RCSB-PDB)