Travaux dirigés

1 - Utilisation de RASTOP pour visualiser un fragment de molécule d'ADN et d'ARN ainsi qu'une protéine

logiciel RASTOP - Ouvrir (rechercher le dossier Data dans RASTOPvf) - Molécules- ADN puis ARN puis....

* ADN (reconnaître les deux brins antiparallèles, la forme en hélice (grand et petit sillon, nombre de paires de bases par tour) la composition d'un nucléotide, les liaisons covalentes (phosphodiester) entre nucléotides d'une chaîne, les liaisons hydrogène entre nucléotides complémentaires des deux chaînes)
* ARN (brin unique, nucléotides, liaisons phosphodiester...) (Bordas p 44)

* protéine....

2 - Utilisation d'ANAGÈNE pour visualiser le rôle d'un gène^bm

logiciel ANAGÈNE - Fichier - Ouvrir - choisir la base de données des séquences

* gène de la chaîne ß de l'hémoglobine humaine (HbA)
afficher la séquence des deux brins de l'ADN et la séquence de l'ARNm théorique à partir duquel serait synthétisé la chaîne ß de l'hémoglobine humaine que l'on affichera en dernier

* comparer (fonction automatique) les séquences des brins d'ADN codants, les séquences des ARNm et les séquences des polypeptides obtenus pour la chaîne ß de l'hémoglobine humaine, forme A et forme S. Consultez aussi les documents accompagnant les séquences et votre livre p 16-17 et 47

Remarque: vous pouvez aussi visionner de nombreuses molécules à l'adresse http://www.didier-pol.net/7infolist.htm

Exercices:

1. Un acide aminé a pour formule générale R-CHCOOHNH₂ , R étant un radical qui change selon les aa (COOH étant la fonction "acide carboxylique" et NH2 la fonction "amine"). D'autre part une liaison peptidique est établie avec départ d'eau entre le COOH d'un premier acide aminé (dont on place par convention toujours l'extrémité NH2 à gauche) et le NH2 d'un second acide aminé. Les peptides sont donc toujours présentés avec leur extrémité NH2 à gauche et leur extrémité COOH à droite.
Le plus simple des aa est la Glycine (Gly) (avec R = H ), vient ensuite l'Alanine (Ala) (R = CH3). Les deux acides aminés à cycle aromatique benzénique sont la Phénylalanine (Phe) (R = CH₂-C₆H₅) et la Tyrosine (Tyr) (R = CH₂-C₆H₄OH, l'OH étant positionné à l'opposé du CH₂).

Écrire la formule développée du dipeptide: Ala -Tyr et du tripeptide Gly - Phe - Tyr

1 ; Combien d'ARNm peuvent correspondre à une séquence donnée d'acides aminés ? Pour en avoir une idée approximative écrire toutes les séquences possibles d'ARNm codant pour le tripeptide Leu-Met-Tyr

2 - Exercice n°4, Bordas p 56

3 - Exercice n°5 Bordas p 56