1. Les logiciels comme JSmol ne sont pas vraiment des
logiciels de visualisation de molécules
naturelles
parce que la
position des atomes mesurée par cristallographie
est incertaine
parce que la
position de certains atomes comme l'hydrogène n'est
pas accessible
parce que
les molécules étudiées sont
fabriquées artificellement et que contrairement
à une vision "chimique" du vivant on peut penser
qu'il existe des différences entre deux
molécules de même formule trouvées
dans des environnements différents : l'un vivant,
l'autre non.
2. Les acides nucléiques sont des acides,
alors qu'ils possèdent des bases
parce qu'ils
possèdent des groupes fonctionnels acides : -COOH
parce que
leur acidité vient principalement de leur charge
négative au niveau de leurs groupes phosphates: PO43-
parce que
les bases azotées qu'ils contiennent sont des bases
très faibles et que les sucres sont des acides
3. Dans l'ADN un nucléotide est lié
au
nucléotide précédant dans sa
chaîne par sa base azotée
au
nucléotide suivant dans sa chaîne par son
groupement phosphate
au
nucléotide complémentaire de l'autre brin
par sa base azotée
4. Un brin d'ADN et une molécule d'ARN
différent
par leurs
bases azotées
par leur
sucre
par les
liaisons covalentes entre leurs nucléotides
5. Les acides aminés
sont des
acides, car ils possèdent le groupement -NH2
naturels
sont au nombre de 4
peuvent
s'associer par des liaisons peptidiques (-C=O-NH-)
établies entre leurs groupes fonctionnels amine
et acide carboxylique
6. Les polymères
sont des
molécules composées de sous-unités
identiques : les monomères
sont
majoritaires dans la cellule : ce sont les acides
nucléiques, les peptides et les osides
de type
copolymères peuvent comporter des monomères
différents comme dans le cas des peptides ou des
acides nucléiques, ou des monomères tous
identiques, comme le plus souvent dans les osides comme la
cellulose.
7. Les protéines au
sens strict
sont des
polymères dont le poids moléculaire est
supérieur à 10.000 daltons
sont des
polymères d'acides aminés
sont des
polymères de nucléotides
8. Dans une cellule
l'eau libre
est majoritaire (typiquement 70%) : c'est de l'eau liquide
et les éléments qui composent la cellule
sont en solution
les
molécules organiques - contenant du carbone et
fabriquées par la cellule - sont toutes
hydratées et l'eau libre ne représente que
moins de 20% de l'eau cellulaire
les
molécules organiques sont toutes des
polymères
9. Les protéines
ont une
structure primaire qui dépend de la nature et de
l'ordre des aa qui composent sa séquence
ont des
structures (secondaires et tertiaires) maintenues par des
liaisons faibles
(hydrogène, hydrophobe...) et fortes
(covalentes, comme les ponts disulfure....)
peuvent
avoir une structure quaternaire qui dépend de
l'association de plusieurs chaînes d'acides
aminés et éventuellement
d'éléments non peptidiques (comme l'hème
de l'hémoglobine).
10. Les ARN
sont des
polymères de dfésoxyribonucléotides
sont des
polymères de ribonucléotides
peuvent
avoir une structure dans l'espace fort complexe
grâce au repliement de leur unique brin et aux
liaisons hydrogène établies entre bases
complémentaires dans des portions de la
chaîne, alors plus ou moins en hélice, comme
dans l'ADN.
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